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Recurrent DGCR8, DROSHA, and SIX Homeodomain Mutations in Favorable Histology Wilms Tumors

Walz, Amy l ; Ooms, Ariadne ; Gadd, Samantha ; Gerhard, Daniela s ; Smith, Malcolm a ; Guidry auvil, Jaime M ; Meerzaman, Daoud ; Chen, Qing-Rong ; Hsu, Chih hao ; Yan, Chunhua ; Nguyen, Cu ; Hu, Ying ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Ma, Yussanne ; Mungall, Andrew j ; Moore, Richard a ; Schein, Jacqueline ; Marra, Marco a ; Huff, Vicki ; Dome, Jeffrey s ; Chi, Yueh-Yun ; Mullighan, Charles g ; Ma, Jing ; Wheeler, David a ; Hampton, Oliver a ; Jafari, Nadereh ; Ross, Nicole ; Gastier-Foster, Julie m ; Perlman, Elizabeth j

Cancer Cell, 09 February 2015, Vol.27(2), pp.286-297 [Peer Reviewed Journal]

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Integrated Molecular Characterization of Uterine Carcinosarcoma

Cherniack, Andrew D ; Shen, Hui ; Walter, Vonn ; Stewart, Chip ; Murray, Bradley A ; Bowlby, Reanne ; Hu, Xin ; Ling, Shiyun ; Soslow, Robert A ; Broaddus, Russell R ; Zuna, Rosemary E ; Robertson, Gordon ; Laird, Peter W ; Kucherlapati, Raju ; Mills, Gordon B ; Akbani, Rehan ; Ally, Adrian ; Auman, J. Todd ; Balasundaram, Miruna ; Balu, Saianand ; Baylin, Stephen B ; Beroukhim, Rameen ; Bodenheimer, Tom ; Bogomolniy, Faina ; Boice, Lori ; Bootwalla, Moiz S ; Bowen, Jay ; Bowlby, Reanne ; Broaddus, Russell ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Cherniack, Andrew D ; Cho, Juok ; Chuah, Eric ; Chudamani, Sudha ; Cibulskis, Kristian ; Cline, Melissa ; Dao, Fanny ; David, Mutch ; Demchok, John A ; Dhalla, Noreen ; Dowdy, Sean ; Felau, Ina ; Ferguson, Martin L ; Frazer, Scott ; Frick, Jessica ; Gabriel, Stacey ; Gastier-Foster, Julie M ; Gehlenborg, Nils ; Gerken, Mark ; Getz, Gad ; Gupta, Manaswi ; Haussler, David ; Hayes, D. Neil ; Heiman, David I ; Hess, Julian ; Hoadley, Katherine A ; Hoffmann, Robert ; Holt, Robert A ; Hoyle, Alan P ; Hu, Xin ; Huang, Mei ; Hutter, Carolyn M ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Steven J.M ; Jones, Corbin D ; Kanchi, Rupa S ; Kandoth, Cyriac ; Kasaian, Katayoon ; Kerr, Sarah ; Kim, Jaegil ; Lai, Phillip H ; Laird, Peter W ; Lander, Eric ; Lawrence, Michael S ; Lee, Darlene ; Leraas, Kristen M ; Leshchiner, Ignaty ; Levine, Douglas A ; Lichtenberg, Tara M ; Lin, Pei ; Ling, Shiyun ; Liu, Jia ; Liu, Wenbin ; Liu, Yuexin ; Lolla, Laxmi ; Lu, Yiling ; Ma, Yussanne ; Maglinte, Dennis T ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Meng, Shaowu ; Meyerson, Matthew ; Mieczkowski, Piotr A ; Mills, Gordon B ; Moore, Richard A ; Mose, Lisle E ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Murray, Bradley A ; Naresh, Rashi ; Noble, Michael S ; Olvera, Narciso ; Parker, Joel S ; Perou, Charles M ; Perou, Amy H ; Pihl, Todd ; Radenbaugh, Amie J ; Ramirez, Nilsa C ; Rathmell, W. Kimryn ; Roach, Jeffrey ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Saksena, Gordon ; Salvesen, Helga B ; Schein, Jacqueline E ; Schumacher, Steven E ; Shen, Hui ; Sheth, Margi ; Shi, Yan ; Shih, Juliann ; Simons, Janae V ; Sipahimalani, Payal ; Skelly, Tara ; Sofia, Heidi J ; Soloway, Matthew G ; Soslow, Robert A ; Sougnez, Carrie ; Stewart, Chip ; Sun, Charlie ; Tam, Angela ; Tan, Donghui ; Tarnuzzer, Roy ; Thiessen, Nina ; Thorne, Leigh B ; Tse, Kane ; Tseng, Jill ; Van Den Berg, David J ; Veluvolu, Umadevi ; Verhaak, Roel G.W ; Voet, Doug ; Von Bismarck, Amanda ; Walter, Vonn ; Wan, Yunhu ; Wang, Zhining ; Wang, Chen ; Weinstein, John N ; Weisenberger, Daniel J ; Wilkerson, Matthew D ; Winterhoff, Boris ; Wise, Lisa ; Wong, Tina ; Wu, Ye ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Zhang, Hailei ; Zhang, Wei ; Zhu, Jing-Chun ; Zmuda, Erik ; Zuna, Rosemary E ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiashan ; Akbani, Rehan ; Levine, Douglas A

Cancer Cell, 13 March 2017, Vol.31(3), pp.411-423 [Peer Reviewed Journal]

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Comparative Molecular Analysis of Gastrointestinal Adenocarcinomas

Liu, Yang ; Sethi, Nilay S ; Hinoue, Toshinori ; Schneider, Barbara G ; Cherniack, Andrew D ; Sanchez-Vega, Francisco ; Seoane, Jose A ; Farshidfar, Farshad ; Bowlby, Reanne ; Islam, Mirazul ; Kim, Jaegil ; Chatila, Walid ; Akbani, Rehan ; Kanchi, Rupa S ; Rabkin, Charles S ; Willis, Joseph E ; Wang, Kenneth K ; Mccall, Shannon J ; Mishra, Lopa ; Ojesina, Akinyemi I ; Bullman, Susan ; Pedamallu, Chandra Sekhar ; Lazar, Alexander J ; Sakai, Ryo ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; Bruijn, Inode ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin ; Mallery, David ; Morris, Scott ; Paulauskis, Joseph ; Penny, Robert ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Sherman, Mark ; Thompson, Eric ; Yena, Peggy ; Bowen, Jay

Cancer Cell, 09 April 2018, Vol.33(4), pp.721-735.e8 [Peer Reviewed Journal]

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The Integrated Genomic Landscape of Thymic Epithelial Tumors

Radovich, Milan ; Pickering, Curtis R ; Felau, Ina ; Ha, Gavin ; Zhang, Hailei ; Jo, Heejoon ; Hoadley, Katherine A ; Anur, Pavana ; Zhang, Jiexin ; Mclellan, Mike ; Bowlby, Reanne ; Matthew, Thomas ; Danilova, Ludmila ; Hegde, Apurva M ; Kim, Jaegil ; Leiserson, Mark D.M ; Sethi, Geetika ; Lu, Charles ; Ryan, Michael ; Su, Xiaoping ; Cherniack, Andrew D ; Robertson, Gordon ; Akbani, Rehan ; Spellman, Paul ; Weinstein, John N ; Hayes, D. Neil ; Raphael, Ben ; Lichtenberg, Tara ; Leraas, Kristen ; Zenklusen, Jean Claude ; Ally, Adrian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Auman, J. Todd ; Balasundaram, Miruna ; Balu, Saianand ; Behera, Madhusmita ; Beroukhim, Rameen ; Berrios, Mario ; Blandino, Giovanni ; Bodenheimer, Tom ; Bootwalla, Moiz S ; Bowen, Jay ; Brooks, Denise ; Carcano, Flavio M ; Carlsen, Rebecca ; Carvalho, Andre L ; Castro, Patricia ; Chalabreysse, Lara ; Chin, Lynda ; Cho, Juok ; Choe, Gina ; Chuah, Eric ; Chudamani, Sudha ; Cibulskis, Carrie ; Cope, Leslie ; Cordes, Matthew G ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Defreitas, Timothy ; Demchok, John A ; Detterbeck, Frank ; Dhalla, Noreen ; Dienemann, Hendrik ; Edenfield, W. Jeff ; Facciolo, Francesco ; Ferguson, Martin L ; Frazer, Scott ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Gabriel, Stacey B ; Gardner, Johanna ; Gastier-Foster, Julie M ; Gehlenborg, Nils ; Gerken, Mark ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Hobensack, Shital ; Holbrook, Andrea ; Holt, Robert A ; Hoyle, Alan P ; Hutter, Carolyn M ; Ittmann, Michael ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Kim, Jaegil ; Kimes, Patrick K ; Lai, Phillip H ; Laird, Peter W ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Lu, Yiling ; Ma, Yussanne ; Maglinte, Dennis T ; Mallery, David ; Mardis, Elaine R ; Marra, Marco A ; Martin, Julie ; Mayo, Michael ; Meier, Sam ; Meister, Michael ; Meng, Shaowu ; Meyerson, Matthew ; Mieczkowski, Piotr A ; Miller, Christopher A ; Mills, Gordon B ; Moore, Richard A ; Morris, Scott ; Mose, Lisle E ; Muley, Thomas ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Naresh, Rashi ; Newton, Yulia ; Noble, Michael S ; Owonikoko, Taofeek ; Parker, Joel S ; Paulaskis, Joseph ; Penny, Robert ; Perou, Charles M ; Perrin, Corinne ; Pihl, Todd ; Radenbaugh, Amie ; Ramalingam, Suresh ; Ramirez, Nilsa ; Rieker, Ralf ; Roach, Jeffrey ; Sadeghi, Sara ; Saksena, Gordon ; Schein, Jacqueline E ; Schmidt, Heather K ; Schumacher, Steven E ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Shi, Yan ; Shih, Juliann ; Sica, Gabriel ; Silveira, Henrique C.S ; Simons, Janae V ; Sipahimalani, Payal ; Skelly, Tara ; Sofia, Heidi J ; Soloway, Matthew G ; Stuart, Joshua ; Sun, Qiang ; Tam, Angela ; Tan, Donghui ; Tarnuzzer, Roy ; Thiessen, Nina ; Van Den Berg, David J ; Vasef, Mohammad A ; Veluvolu, Umadevi ; Voet, Doug ; Walter, Vonn ; Wan, Yunhu ; Wang, Zhining ; Warth, Arne ; Weis, Cleo-Aron ; Weisenberger, Daniel J ; Wilkerson, Matthew D ; Wise, Lisa ; Wong, Tina ; Wu, Hsin-Ta ; Wu, Ye ; Yang, Liming ; Zhang, Jiashan ; Zmuda, Erik ; Fujimoto, Junya ; Scapulatempo-Neto, Cristovam ; Moreira, Andre L ; Hwang, David ; Huang, James ; Marino, Mirella ; Korst, Robert ; Giaccone, Giuseppe ; Gokmen-Polar, Yesim ; Badve, Sunil ; Rajan, Arun ; Ströbel, Philipp ; Girard, Nicolas ; Tsao, Ming S ; Marx, Alexander ; Tsao, Anne S ; Loehrer, Patrick J

Cancer Cell, 12 February 2018, Vol.33(2), pp.244-258.e10 [Peer Reviewed Journal]

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Comprehensive Molecular Characterization of Pheochromocytoma and Paraganglioma

Fishbein, Lauren ; Leshchiner, Ignaty ; Walter, Vonn ; Danilova, Ludmila ; Robertson, A. Gordon ; Johnson, Amy R ; Lichtenberg, Tara M ; Murray, Bradley A ; Ghayee, Hans K ; Else, Tobias ; Ling, Shiyun ; Jefferys, Stuart R ; de Cubas, Aguirre A ; Wenz, Brandon ; Korpershoek, Esther ; Amelio, Antonio L ; Makowski, Liza ; Rathmell, W. Kimryn ; Gimenez-Roqueplo, Anne-Paule ; Giordano, Thomas J ; Asa, Sylvia L ; Tischler, Arthur S ; Akbani, Rehan ; Ally, Adrian ; Amar, Laurence ; Amelio, Antonio L ; Arachchi, Harindra ; Asa, Sylvia L ; Auchus, Richard J ; Auman, J. Todd ; Baertsch, Robert ; Balasundaram, Miruna ; Balu, Saianand ; Bartsch, Detlef K ; Baudin, Eric ; Bauer, Thomas ; Beaver, Allison ; Benz, Christopher ; Beroukhim, Rameen ; Beuschlein, Felix ; Bodenheimer, Tom ; Boice, Lori ; Bowen, Jay ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Carter, Suzie ; Cassol, Clarissa A ; Cherniack, Andrew D ; Chin, Lynda ; Cho, Juok ; Chuah, Eric ; Chudamani, Sudha ; Cope, Leslie ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Danilova, Ludmila ; de Cubas, Aguirre A ; de Krijger, Ronald R ; Demchok, John A ; Deutschbein, Timo ; Dhalla, Noreen ; Dimmock, David ; Dinjens, Winand N.M ; Else, Tobias ; Eng, Charis ; Eschbacher, Jennifer ; Fassnacht, Martin ; Felau, Ina ; Feldman, Michael ; Ferguson, Martin L ; Fiddes, Ian ; Fishbein, Lauren ; Frazer, Scott ; Gabriel, Stacey B ; Gardner, Johanna ; Gastier-Foster, Julie M ; Gehlenborg, Nils ; Gerken, Mark ; Getz, Gad ; Geurts, Jennifer ; Ghayee, Hans K ; Gimenez-Roqueplo, Anne-Paule ; Giordano, Thomas J ; Goldman, Mary ; Graim, Kiley ; Gupta, Manaswi ; Haan, David ; Hahner, Stefanie ; Hantel, Constanze ; Haussler, David ; Hayes, D. Neil ; Heiman, David I ; Hoadley, Katherine A ; Holt, Robert A ; Hoyle, Alan P ; Huang, Mei ; Hunt, Bryan ; Hutter, Carolyn M ; Jefferys, Stuart R ; Johnson, Amy R ; Jones, Steven J.M ; Jones, Corbin D ; Kasaian, Katayoon ; Kebebew, Electron ; Kim, Jaegil ; Kimes, Patrick ; Knijnenburg, Theo ; Korpershoek, Esther ; Lander, Eric ; Lawrence, Michael S ; Lechan, Ronald ; Lee, Darlene ; Leraas, Kristen M ; Lerario, Antonio ; Leshchiner, Ignaty ; Lichtenberg, Tara M ; Lin, Pei ; Ling, Shiyun ; Liu, Jia ; Livolsi, Virginia A ; Lolla, Laxmi ; Lotan, Yair ; Lu, Yiling ; Ma, Yussanne ; Maison, Nicole ; Makowski, Liza ; Mallery, David ; Mannelli, Massimo ; Marquard, Jessica ; Marra, Marco A ; Matthew, Thomas ; Mayo, Michael ; Méatchi, Tchao ; Meng, Shaowu ; Merino, Maria J ; Mete, Ozgur ; Meyerson, Matthew ; Mieczkowski, Piotr A ; Mills, Gordon B ; Moore, Richard A ; Morozova, Olena ; Morris, Scott ; Mose, Lisle E ; Mungall, Andrew J ; Murray, Bradley A ; Naresh, Rashi ; Nathanson, Katherine L ; Newton, Yulia ; Ng, Sam ; Ni, Ying ; Noble, Michael S ; Nwariaku, Fiemu ; Pacak, Karel ; Parker, Joel S ; Paul, Evan ; Penny, Robert ; Perou, Charles M ; Perou, Amy H ; Pihl, Todd ; Powers, James ; Rabaglia, Jennifer ; Radenbaugh, Amie ; Ramirez, Nilsa C ; Rao, Arjun ; Rathmell, W. Kimryn ; Riester, Anna ; Roach, Jeffrey ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Saksena, Gordon ; Salama, Sofie ; Saller, Charles ; Sandusky, George ; Sbiera, Silviu ; Schein, Jacqueline E ; Schumacher, Steven E ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Sheth, Margi ; Shi, Yan ; Shih, Juliann ; Shmulevich, Ilya ; Simons, Janae V ; Sipahimalani, Payal ; Skelly, Tara ; Sofia, Heidi J ; Sokolov, Artem ; Soloway, Matthew G ; Sougnez, Carrie ; Stuart, Josh ; Sun, Charlie ; Swatloski, Teresa ; Tam, Angela ; Tan, Donghui ; Tarnuzzer, Roy ; Tarvin, Katherine ; Thiessen, Nina ; Thorne, Leigh B ; Timmers, Henri J ; Tischler, Arthur S ; Tse, Kane ; Uzunangelov, Vlado ; van Berkel, Anouk ; Veluvolu, Umadevi ; Vicha, Ales ; Voet, Doug ; Waldmann, Jens ; Walter, Vonn ; Wan, Yunhu ; Wang, Zhining ; Wang, Tracy S ; Weaver, Joellen ; Weinstein, John N ; Weismann, Dirk ; Wenz, Brandon ; Wilkerson, Matthew D ; Wise, Lisa ; Wong, Tina ; Wong, Christopher ; Wu, Ye ; Yang, Liming ; Zelinka, Tomas ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Zhang, Wei ; Zhu, Jingchun ; Zinzindohoué, Franck ; Zmuda, Erik ; Pacak, Karel ; Nathanson, Katherine L ; Wilkerson, Matthew D

Cancer Cell, 13 February 2017, Vol.31(2), pp.181-193 [Peer Reviewed Journal]

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Integrated Genomic Characterization of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

Raphael, Benjamin J ; Hruban, Ralph H ; Aguirre, Andrew J ; Moffitt, Richard A ; Yeh, Jen Jen ; Stewart, Chip ; Robertson, A. Gordon ; Cherniack, Andrew D ; Gupta, Manaswi ; Getz, Gad ; Gabriel, Stacey B ; Meyerson, Matthew ; Cibulskis, Carrie ; Fei, Suzanne S ; Hinoue, Toshinori ; Shen, Hui ; Laird, Peter W ; Ling, Shiyun ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Akbani, Rehan ; Loher, Phillipe ; Londin, Eric R ; Rigoutsos, Isidore ; Telonis, Aristeidis G ; Gibb, Ewan A ; Goldenberg, Anna ; Mezlini, Aziz M ; Hoadley, Katherine A ; Collisson, Eric ; Lander, Eric ; Murray, Bradley A ; Hess, Julian ; Rosenberg, Mara ; Bergelson, Louis ; Zhang, Hailei ; Cho, Juok ; Tiao, Grace ; Kim, Jaegil ; Livitz, Dimitri ; Leshchiner, Ignaty ; Reardon, Brendan ; Van Allen, Eliezer ; Kamburov, Atanas ; Beroukhim, Rameen ; Saksena, Gordon ; Schumacher, Steven E ; Noble, Michael S ; Heiman, David I ; Gehlenborg, Nils ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Adsay, Volkan ; Petersen, Gloria ; Klimstra, David ; Bardeesy, Nabeel ; Leiserson, Mark D.M ; Bowlby, Reanne ; Kasaian, Katayoon ; Birol, Inanc ; Mungall, Karen L ; Sadeghi, Sara ; Weinstein, John N ; Spellman, Paul T ; Liu, Yuexin ; Amundadottir, Laufey T ; Tepper, Joel ; Singhi, Aatur D ; Dhir, Rajiv ; Paul, Drwiega ; Smyrk, Thomas ; Zhang, Lizhi ; Kim, Paula ; Bowen, Jay ; Frick, Jessica ; Gastier-Foster, Julie M ; Gerken, Mark ; Lau, Kevin ; Leraas, Kristen M ; Lichtenberg, Tara M ; Ramirez, Nilsa C ; Renkel, Jeremy ; Sherman, Mark ; Wise, Lisa ; Yena, Peggy ; Zmuda, Erik ; Shih, Juliann ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Carlsen, Rebecca ; Chu, Andy ; Chuah, Eric ; Clarke, Amanda ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert A ; Jones, Steven J.M ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Brooks, Denise ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Hayes, D. Neil ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Charles M ; Perou, Amy H ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Korkut, Anil ; Senbabaoglu, Yasin ; Burch, Patrick ; Mcwilliams, Robert ; Chaffee, Kari ; Oberg, Ann ; Zhang, Wei ; Gingras, Marie-Claude ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Albert, Monique ; Bartlett, John ; Sekhon, Harman ; Stephen, Yeager ; Howard, Zaren ; Judy, Miller ; Breggia, Anne ; Shroff, Rachna T ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Jennifer, Smith ; Roggin, Kevin ; Becker, Karl-Friedrich ; Behera, Madhusmita ; Bennett, Joseph ; Boice, Lori ; Burks, Eric ; Carlotti Junior, Carlos Gilberto ; Chabot, John ; Pretti Da Cunha Tirapelli, Daniela ; Sebastião Dos Santos, Jose ; Dubina, Michael ; Eschbacher, Jennifer ; Huang, Mei ; Huelsenbeck-Dill, Lori ; Jenkins, Roger ; Karpov, Alexey ; Kemp, Rafael ; Lyadov, Vladimir ; Maithel, Shishir ; Manikhas, Georgy ; Montgomery, Eric ; Noushmehr, Houtan ; Osunkoya, Adeboye ; Owonikoko, Taofeek ; Paklina, Oxana ; Potapova, Olga ; Ramalingam, Suresh ; Rathmell, W. Kimryn ; Rieger-Christ, Kimberly ; Saller, Charles ; Setdikova, Galiya ; Shabunin, Alexey ; Sica, Gabriel ; Su, Tao ; Sullivan, Travis ; Swanson, Pat ; Tarvin, Katherine ; Tavobilov, Michael ; Thorne, Leigh B ; Urbanski, Stefan ; Voronina, Olga ; Wang, Timothy ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Mallery, David ; Morris, Scott ; Paulauskis, Joseph ; Penny, Robert ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Janssen, Klaus-Peter ; Bathe, Oliver ; Bahary, Nathan ; Slotta-Huspenina, Julia ; Johns, Amber ; Hibshoosh, Hanina ; Hwang, Rosa F ; Sepulveda, Antonia ; Radenbaugh, Amie ; Baylin, Stephen B ; Berrios, Mario ; Bootwalla, Moiz S ; Holbrook, Andrea ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Mahurkar, Swapna ; Triche, Timothy J ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Chin, Lynda ; Kucherlapati, Raju ; Kucherlapati, Melanie ; Pantazi, Angeliki ; Park, Peter ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Lin, Pei ; Frazer, Scott ; Defreitas, Timothy ; Meier, Sam ; Chin, Lynda ; Kwon, Sun Young ; Kim, Yong Hoon ; Park, Sang-Jae ; Han, Sung-Sik ; Kim, Seong Hoon ; Kim, Hark ; Furth, Emma ; Tempero, Margaret ; Sander, Chris ; Biankin, Andrew ; Chang, David

Cancer Cell, 14 August 2017, Vol.32(2), pp.185-203.e13 [Peer Reviewed Journal]

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Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients

Kahles, André ; Lehmann, Kjong-Van ; Toussaint, Nora C ; Hüser, Matthias ; Stark, Stefan G ; Sachsenberg, Timo ; Stegle, Oliver ; Kohlbacher, Oliver ; Sander, Chris ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; de Bruijn, Ino ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin ; Mallery, David ; Morris, Scott ; Paulauskis, Joseph ; Penny, Robert ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Sherman, Mark ; Thompson, Eric ; Yena, Peggy ; Bowen, Jay ; Gastier-Foster, Julie M ; Gerken, Mark ; Leraas, Kristen M ; Lichtenberg, Tara M ; Ramirez, Nilsa C ; Wise, Lisa ; Zmuda, Erik ; Corcoran, Niall ; Costello, Tony ; Hovens, Christopher ; Carvalho, Andre L ; de Carvalho, Ana C ; Fregnani, José H ; Longatto-Filho, Adhemar ; Reis, Rui M

Cancer Cell, 13 August 2018, Vol.34(2), pp.211-224.e6 [Peer Reviewed Journal]

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Genomic and Functional Approaches to Understanding Cancer Aneuploidy

Taylor, Alison M ; Shih, Juliann ; Ha, Gavin ; Gao, Galen F ; Zhang, Xiaoyang ; Berger, Ashton C ; Schumacher, Steven E ; Wang, Chen ; Hu, Hai ; Liu, Jianfang ; Lazar, Alexander J ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; de Bruijn, Ino ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin ; Mallery, David ; Morris, Scott ; Paulauskis, Joseph ; Penny, Robert ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Sherman, Mark ; Thompson, Eric ; Yena, Peggy ; Bowen, Jay ; Gastier-Foster, Julie M ; Gerken, Mark ; Leraas, Kristen M ; Lichtenberg, Tara M ; Ramirez, Nilsa C ; Wise, Lisa ; Zmuda, Erik ; Corcoran, Niall ; Costello, Tony ; Hovens, Christopher ; Carvalho, Andre L ; de Carvalho, Ana C ; Fregnani, José H

Cancer Cell, 09 April 2018, Vol.33(4), pp.676-689.e3 [Peer Reviewed Journal]

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lncRNA Epigenetic Landscape Analysis Identifies EPIC1 as an Oncogenic lncRNA that Interacts with MYC and Promotes Cell-Cycle Progression in Cancer

Wang, Zehua ; Yang, Bo ; Zhang, Min ; Guo, Weiwei ; Wu, Zhiyuan ; Wang, Yue ; Jia, Lin ; Li, Song ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; Bruijn, Inode ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin ; Mallery, David ; Morris, Scott ; Paulauskis, Joseph ; Penny, Robert ; Shelton, Candace ; Shelton, Troy ; Sherman, Mark ; Thompson, Eric ; Yena, Peggy ; Bowen, Jay ; Gastier-Foster, Julie M ; Gerken, Mark ; Leraas, Kristen M ; Lichtenberg, Tara M ; Ramirez, Nilsa C ; Wise, Lisa ; Zmuda, Erik ; Corcoran, Niall ; Costello, Tony ; Hovens, Christopher ; Carvalho, Andre L ; de Carvalho, Ana C ; Fregnani, José H ; Longatto-Filho, Adhemar ; Reis, Rui M ; Scapulatempo-Neto, Cristovam

Cancer Cell, 09 April 2018, Vol.33(4), pp.706-720.e9 [Peer Reviewed Journal]

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Integrative Analysis Identifies Four Molecular and Clinical Subsets in Uveal Melanoma

Robertson, A. Gordon ; Shih, Juliann ; Yau, Christina ; Gibb, Ewan A ; Oba, Junna ; Mungall, Karen L ; Hess, Julian M ; Uzunangelov, Vladislav ; Walter, Vonn ; Danilova, Ludmila ; Lichtenberg, Tara M ; Kucherlapati, Melanie ; Kimes, Patrick K ; Tang, Ming ; Penson, Alexander ; Babur, Ozgun ; Akbani, Rehan ; Bristow, Christopher A ; Hoadley, Katherine A ; Iype, Lisa ; Chang, Matthew T ; Abdel-Rahman, Mohamed H ; Akbani, Rehan ; Ally, Adrian ; Auman, J. Todd ; Babur, Ozgun ; Balasundaram, Miruna ; Balu, Saianand ; Benz, Christopher ; Beroukhim, Rameen ; Birol, Inanc ; Bodenheimer, Tom ; Bowen, Jay ; Bowlby, Reanne ; Bristow, Christopher A ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Cebulla, Colleen M ; Chang, Matthew T ; Cherniack, Andrew D ; Chin, Lynda ; Cho, Juok ; Chuah, Eric ; Chudamani, Sudha ; Cibulskis, Carrie ; Cibulskis, Kristian ; Cope, Leslie ; Coupland, Sarah E ; Danilova, Ludmila ; Defreitas, Timothy ; Demchok, John A ; Desjardins, Laurence ; Dhalla, Noreen ; Esmaeli, Bita ; Felau, Ina ; Ferguson, Martin L ; Frazer, Scott ; Gabriel, Stacey B ; Gastier-Foster, Julie M ; Gehlenborg, Nils ; Gerken, Mark ; Gershenwald, Jeffrey E ; Getz, Gad ; Gibb, Ewan A ; Griewank, Klaus G ; Grimm, Elizabeth A ; Hayes, D. Neil ; Hegde, Apurva M ; Heiman, David I ; Helsel, Carmen ; Hess, Julian M ; Hoadley, Katherine A ; Hobensack, Shital ; Holt, Robert A ; Hoyle, Alan P ; Hu, Xin ; Hutter, Carolyn M ; Jager, Martine J ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Jones, Steven J.M ; Kandoth, Cyriac ; Kasaian, Katayoon ; Kim, Jaegil ; Kimes, Patrick K ; Kucherlapati, Melanie ; Kucherlapati, Raju ; Lander, Eric ; Lawrence, Michael S ; Lazar, Alexander J ; Lee, Semin ; Leraas, Kristen M ; Lichtenberg, Tara M ; Lin, Pei ; Liu, Jia ; Liu, Wenbin ; Lolla, Laxmi ; Lu, Yiling ; Iype, Lisa ; Ma, Yussanne ; Mahadeshwar, Harshad S ; Mariani, Odette ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Meier, Sam ; Meng, Shaowu ; Meyerson, Matthew ; Mieczkowski, Piotr A ; Mills, Gordon B ; Moore, Richard A ; Mose, Lisle E ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen L ; Murray, Bradley A ; Naresh, Rashi ; Noble, Michael S ; Oba, Junna ; Pantazi, Angeliki ; Parfenov, Michael ; Park, Peter J ; Parker, Joel S ; Penson, Alexander ; Perou, Charles M ; Pihl, Todd ; Pilarski, Robert ; Protopopov, Alexei ; Radenbaugh, Amie ; Rai, Karan ; Ramirez, Nilsa C ; Ren, Xiaojia ; Reynolds, Sheila M ; Roach, Jeffrey ; Robertson, A. Gordon ; Roman-Roman, Sergio ; Roszik, Jason ; Sadeghi, Sara ; Saksena, Gordon ; Sastre, Xavier ; Schadendorf, Dirk ; Schein, Jacqueline E ; Schoenfield, Lynn ; Schumacher, Steven E ; Seidman, Jonathan ; Seth, Sahil ; Sethi, Geetika ; Sheth, Margi ; Shi, Yan ; Shields, Carol ; Shih, Juliann ; Shmulevich, Ilya ; Simons, Janae V ; Singh, Arun D ; Sipahimalani, Payal ; Skelly, Tara ; Sofia, Heidi ; Soloway, Matthew G ; Song, Xingzhi ; Stern, Marc-Henri ; Stuart, Joshua ; Sun, Qiang ; Sun, Huandong ; Tam, Angela ; Tan, Donghui ; Tang, Ming ; Tang, Jiabin ; Tarnuzzer, Roy ; Taylor, Barry S ; Thiessen, Nina ; Thorsson, Vesteinn ; Tse, Kane ; Uzunangelov, Vladislav ; Veluvolu, Umadevi ; Verhaak, Roel G.W ; Voet, Doug ; Walter, Vonn ; Wan, Yunhu ; Wang, Zhining ; Weinstein, John N ; Wilkerson, Matthew D ; Williams, Michelle D ; Wise, Lisa ; Woodman, Scott E ; Wong, Tina ; Wu, Ye ; Yang, Liming ; Yang, Lixing ; Yau, Christina ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan ; Zhang, Hailei ; Zmuda, Erik ; Cherniack, Andrew D ; Benz, Christopher ; Mills, Gordon B ; Verhaak, Roel G.W ; Griewank, Klaus G ; Felau, Ina ; Zenklusen, Jean C ; Gershenwald, Jeffrey E ; Schoenfield, Lynn ; Lazar, Alexander J ; Abdel-Rahman, Mohamed H ; Roman-Roman, Sergio ; Stern, Marc-Henri ; Cebulla, Colleen M ; Williams, Michelle D ; Jager, Martine J ; Coupland, Sarah E ; Esmaeli, Bita ; Kandoth, Cyriac ; Woodman, Scott E

Cancer Cell, 14 August 2017, Vol.32(2), pp.204-220.e15 [Peer Reviewed Journal]

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