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Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas.

Sanchez-Vega, Francisco ; Mina, Marco ; Armenia, Joshua ; Chatila, Walid K ; Luna, Augustin ; La, Konnor C ; Dimitriadoy, Sofia ; Liu, David L ; Kantheti, Havish S ; Saghafinia, Sadegh ; Chakravarty, Debyani ; Daian, Foysal ; Gao, Qingsong ; Bailey, Matthew H ; Liang, Wen-Wei ; Foltz, Steven M ; Shmulevich, Ilya ; Ding, Li ; Heins, Zachary ; Ochoa, Angelica ; Gross, Benjamin ; Gao, Jianjiong ; Zhang, Hongxin ; Kundra, Ritika ; Kandoth, Cyriac ; Bahceci, Istemi ; Dervishi, Leonard ; Dogrusoz, Ugur ; Zhou, Wanding ; Shen, Hui ; Laird, Peter W ; Way, Gregory P ; Greene, Casey S ; Liang, Han ; Xiao, Yonghong ; Wang, Chen ; Iavarone, Antonio ; Berger, Alice H ; Bivona, Trever G ; Lazar, Alexander J ; Hammer, Gary D ; Giordano, Thomas ; Kwong, Lawrence N ; Mcarthur, Grant ; Huang, Chenfei ; Tward, Aaron D ; Frederick, Mitchell J ; Mccormick, Frank ; Meyerson, Matthew ; Van Allen, Eliezer M ; Cherniack, Andrew D ; Ciriello, Giovanni ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sanchez-Vega, Francisco Caesar-Johnson, Samantha J (correspondence author) ; Demchok, John A (record owner) ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan Julia ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; de Bruijn, Ino ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min

Cell, April 5, 2018, Vol.173(2), pp.321-337.e10 [Peer Reviewed Journal]

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Bailey, Matthew H ; Tokheim, Collin ; Porta-Pardo, Eduard ; Sengupta, Sohini ; Bertrand, Denis ; Weerasinghe, Amila ; Colaprico, Antonio ; Wendl, Michael C ; Kim, Jaegil ; Reardon, Brendan ; Ng, Patrick Kwok-Shing ; Jeong, Kang Jin ; Cao, Song ; Wang, Zixing ; Gao, Jianjiong ; Gao, Qingsong ; Wang, Fang ; Liu, Eric Minwei ; Mularoni, Loris ; Rubio-Perez, Carlota ; Nagarajan, Niranjan ; Cortés-Ciriano, Isidro ; Zhou, Daniel Cui ; Liang, Wen-Wei ; Hess, Julian M ; Yellapantula, Venkata D ; Tamborero, David ; Gonzalez-Perez, Abel ; Suphavilai, Chayaporn ; Ko, Jia Yu ; Khurana, Ekta ; Park, Peter J ; Van Allen, Eliezer M ; Liang, Han ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; de Bruijn, Ino ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin

Cell, 05 April 2018, Vol.173(2), pp.371-385.e18 [Peer Reviewed Journal]

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Bailey, Matthew H ; Tokheim, Collin ; Porta-Pardo, Eduard ; Sengupta, Sohini ; Bertrand, Denis ; Weerasinghe, Amila ; Colaprico, Antonio ; Wendl, Michael C ; Kim, Jaegil ; Reardon, Brendan ; Kwok-Shing Ng, Patrick ; Jeong, Kang Jin ; Cao, Song ; Wang, Zixing ; Gao, Jianjiong ; Gao, Qingsong ; Wang, Fang ; Liu, Eric Minwei ; Mularoni, Loris ; Rubio-Perez, Carlota ; Nagarajan, Niranjan ; Cortés-Ciriano, Isidro ; Zhou, Daniel Cui ; Liang, Wen-Wei ; Hess, Julian M ; Yellapantula, Venkata D ; Tamborero, David ; Gonzalez-Perez, Abel ; Suphavilai, Chayaporn ; Ko, Jia Yu ; Khurana, Ekta ; Park, Peter J ; Van Allen, Eliezer M ; Liang, Han ; Caesar-Johnson, Samantha J ; Demchok, John A ; Felau, Ina ; Kasapi, Melpomeni ; Ferguson, Martin L ; Hutter, Carolyn M ; Sofia, Heidi J ; Tarnuzzer, Roy ; Wang, Zhining ; Yang, Liming ; Zenklusen, Jean C ; Zhang, Jiashan (Julia) ; Chudamani, Sudha ; Liu, Jia ; Lolla, Laxmi ; Naresh, Rashi ; Pihl, Todd ; Sun, Qiang ; Wan, Yunhu ; Wu, Ye ; Cho, Juok ; Defreitas, Timothy ; Frazer, Scott ; Gehlenborg, Nils ; Getz, Gad ; Heiman, David I ; Kim, Jaegil ; Lawrence, Michael S ; Lin, Pei ; Meier, Sam ; Noble, Michael S ; Saksena, Gordon ; Voet, Doug ; Zhang, Hailei ; Bernard, Brady ; Chambwe, Nyasha ; Dhankani, Varsha ; Knijnenburg, Theo ; Kramer, Roger ; Leinonen, Kalle ; Liu, Yuexin ; Miller, Michael ; Reynolds, Sheila ; Shmulevich, Ilya ; Thorsson, Vesteinn ; Zhang, Wei ; Akbani, Rehan ; Broom, Bradley M ; Hegde, Apurva M ; Ju, Zhenlin ; Kanchi, Rupa S ; Korkut, Anil ; Li, Jun ; Liang, Han ; Ling, Shiyun ; Liu, Wenbin ; Lu, Yiling ; Mills, Gordon B ; Ng, Kwok-Shing ; Rao, Arvind ; Ryan, Michael ; Wang, Jing ; Weinstein, John N ; Zhang, Jiexin ; Abeshouse, Adam ; Armenia, Joshua ; Chakravarty, Debyani ; Chatila, Walid K ; de Bruijn, Ino ; Gao, Jianjiong ; Gross, Benjamin E ; Heins, Zachary J ; Kundra, Ritika ; La, Konnor ; Ladanyi, Marc ; Luna, Augustin ; Nissan, Moriah G ; Ochoa, Angelica ; Phillips, Sarah M ; Reznik, Ed ; Sanchez-Vega, Francisco ; Sander, Chris ; Schultz, Nikolaus ; Sheridan, Robert ; Sumer, S. Onur ; Sun, Yichao ; Taylor, Barry S ; Wang, Jioajiao ; Zhang, Hongxin ; Anur, Pavana ; Peto, Myron ; Spellman, Paul ; Benz, Christopher ; Stuart, Joshua M ; Wong, Christopher K ; Yau, Christina ; Hayes, D. Neil ; Parker, Joel S ; Wilkerson, Matthew D ; Ally, Adrian ; Balasundaram, Miruna ; Bowlby, Reanne ; Brooks, Denise ; Carlsen, Rebecca ; Chuah, Eric ; Dhalla, Noreen ; Holt, Robert ; Jones, Steven J.M ; Kasaian, Katayoon ; Lee, Darlene ; Ma, Yussanne ; Marra, Marco A ; Mayo, Michael ; Moore, Richard A ; Mungall, Andrew J ; Mungall, Karen ; Robertson, A. Gordon ; Sadeghi, Sara ; Schein, Jacqueline E ; Sipahimalani, Payal ; Tam, Angela ; Thiessen, Nina ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Berger, Ashton C ; Beroukhim, Rameen ; Cherniack, Andrew D ; Cibulskis, Carrie ; Gabriel, Stacey B ; Gao, Galen F ; Ha, Gavin ; Meyerson, Matthew ; Schumacher, Steven E ; Shih, Juliann ; Kucherlapati, Melanie H ; Kucherlapati, Raju S ; Baylin, Stephen ; Cope, Leslie ; Danilova, Ludmila ; Bootwalla, Moiz S ; Lai, Phillip H ; Maglinte, Dennis T ; Van Den Berg, David J ; Weisenberger, Daniel J ; Auman, J. Todd ; Balu, Saianand ; Bodenheimer, Tom ; Fan, Cheng ; Hoadley, Katherine A ; Hoyle, Alan P ; Jefferys, Stuart R ; Jones, Corbin D ; Meng, Shaowu ; Mieczkowski, Piotr A ; Mose, Lisle E ; Perou, Amy H ; Perou, Charles M ; Roach, Jeffrey ; Shi, Yan ; Simons, Janae V ; Skelly, Tara ; Soloway, Matthew G ; Tan, Donghui ; Veluvolu, Umadevi ; Fan, Huihui ; Hinoue, Toshinori ; Laird, Peter W ; Shen, Hui ; Zhou, Wanding ; Bellair, Michelle ; Chang, Kyle ; Covington, Kyle ; Creighton, Chad J ; Dinh, Huyen ; Doddapaneni, Harshavardhan ; Donehower, Lawrence A ; Drummond, Jennifer ; Gibbs, Richard A ; Glenn, Robert ; Hale, Walker ; Han, Yi ; Hu, Jianhong ; Korchina, Viktoriya ; Lee, Sandra ; Lewis, Lora ; Li, Wei ; Liu, Xiuping ; Morgan, Margaret ; Morton, Donna ; Muzny, Donna ; Santibanez, Jireh ; Sheth, Margi ; Shinbrot, Eve ; Wang, Linghua ; Wang, Min ; Wheeler, David A ; Xi, Liu ; Zhao, Fengmei ; Hess, Julian ; Appelbaum, Elizabeth L ; Bailey, Matthew ; Cordes, Matthew G ; Ding, Li ; Fronick, Catrina C ; Fulton, Lucinda A ; Fulton, Robert S ; Kandoth, Cyriac ; Mardis, Elaine R ; Mclellan, Michael D ; Miller, Christopher A ; Schmidt, Heather K ; Wilson, Richard K ; Crain, Daniel ; Curley, Erin ; Gardner, Johanna ; Lau, Kevin

Cell, 09 August 2018, Vol.174(4), pp.1034-1035 [Peer Reviewed Journal]

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