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The Gene Set Builder: collation, curation, and distribution of sets of genes
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The Gene Set Builder: collation, curation, and distribution of sets of genes

Yusuf, Dimas ; Lim, Jonathan ; Wasserman, Wyeth

BMC bioinformatics, 2005-12-21, Vol.6 (1), p.305-305 [Peer Reviewed Journal]

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2
The Gene Set Builder: collation, curation, and distribution of sets of genes
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The Gene Set Builder: collation, curation, and distribution of sets of genes

Yusuf, Dimas ; Lim, Jonathan S ; Wasserman, Wyeth W

BMC bioinformatics, 2005-12-21, Vol.6, p.305-305 [Peer Reviewed Journal]

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3
Gene characterization index: assessing the depth of gene annotation
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Gene characterization index: assessing the depth of gene annotation

Kemmer, Danielle ; Podowski, Raf M ; Yusuf, Dimas ; Brumm, Jochen ; Cheung, Warren ; Wahlestedt, Claes ; Lenhard, Boris ; Wasserman, Wyeth W Valcarcel, Juan

PloS one, 2008-01-23, Vol.3 (1), p.e1440-e1440 [Peer Reviewed Journal]

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4
JASPAR 2010: the greatly expanded open-access database of transcription factor binding profiles
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JASPAR 2010: the greatly expanded open-access database of transcription factor binding profiles

Portales-Casamar, Elodie ; Thongjuea, Supat ; Kwon, Andrew T ; Arenillas, David ; Zhao, Xiaobei ; Valen, Eivind ; Yusuf, Dimas ; Lenhard, Boris ; Wasserman, Wyeth W ; Sandelin, Albin

Nucleic acids research, 2010-01, Vol.38 (Database issue), p.D105-D110 [Peer Reviewed Journal]

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5
The transcription factor encyclopedia
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The transcription factor encyclopedia

Park, Jason ; O'Geen, Henriette ; Héligon, Christophe ; Lim, Jonathan S ; Hankinson, Oliver ; Karrich, Julien J ; Hogenesch, John B ; Van Rechem, Capucine ; Ferrell, Scott ; De Leeuw, Charles N ; De Cristofaro, Tiziana ; Vaz, Michelle ; Fulton, Debra L ; Woodcroft, Mark W ; Sladek, Frances M ; Daniel, Juliet M ; Veitia, Reiner A ; Lam, Eric W-F ; Bolotin, Eugene ; Mancarelli, M Michela ; Cheung, Warren A ; Cullum, Rebecca L ; Tschan, Mario P ; Leprince, Dominique ; Torbett, Bruce E ; LeBrun, David P ; Blom, Bianca ; Benayoun, Bérénice A ; Rhodes, Simon J ; Prince, Kelly L ; Sun, Yunfu ; Mikula, Michal ; Ryffel, Gerhart U ; Dahlman-Wright, Karin ; Dickman, Christopher T D ; Ostrowski, Jerzy ; Lan, Michael S ; Gronostajski, Richard M ; Europe-Finner, G Nicholas ; Hough, Margaret R ; Harvey, Christopher J ; Chen, Edwin ; Raman, Venu ; Olechnowicz, Sam W Z ; Wederell, Elizabeth ; Farnham, Peggy J ; Vesuna, Farhad ; Marco-Ferreres, Raquel ; Nanan, Kyster K ; Waldman, Scott A ; Noy, Peter John ; Schnabl, Jake M ; Beccari, Leonardo L ; Peet, Daniel J ; Zhang, Xiao Yu Cindy ; Biswal, Shyam ; Boulay, Gaylor ; Mandrup, Susanne ; Eijkelenboom, Astrid ; Bradley, Philip H ; Monteiro, Lara J ; Butland, Stefanie L ; Mader, Sylvie ; Hoodless, Pamela A ; Wenger, Roland H ; DeBruyne, Jason P ; Mullen, Rachel D ; Bovolenta, Paola ; Kist, Ralf ; Luo, Xin M ; Millen, Kathleen Joyce ; Putker, Marrit ; Brosens, Jan J ; Brown, Philip J ; Simpson, Elizabeth M ; Zhao, Chunyan ; Vasseur-Cognet, Mireille ; Liedtke, Michaela ; Chakrabarti, Rumela ; Wilson, Miranda S C ; Forrest, Douglas ; Ticoll, Amy ; Frietze, Seth ; Breslin, Mary B ; Rozendaal, Marieke ; Taggart, Michael ; Blank, Marissa Cathleen ; Hou, Juan ; Del Peso, Luis ; Rizzino, Angie ; Reddy, Sekhar P ; Portales-Casamar, Elodie ; Schwenen, Helma D C ; Banham, Alison H ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karolczak-Bayatti, Magdalena ; Yusuf, Dimas ; Swanson, Magdalena I ; Sharlin, David S ; Grontved, Lars ; ... 2012

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6
The Transcription Factor Encyclopedia
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The Transcription Factor Encyclopedia

Yusuf, Dimas ; Butland, Stefanie L ; Swanson, Magdalena I ; Bolotin, Eugene ; Ticoll, Amy ; Cheung, Warren A ; Cindy Zhang, Xiao Yu ; Dickman, Christopher TD ; Fulton, Debra L ; Schnabl, Jake M ; Ramos, Oscar HP ; Vasseur-Cognet, Mireille ; de Leeuw, Charles N ; Ryffel, Gerhart U ; Lam, Eric W-F ; Kist, Ralf ; Wilson, Miranda SC ; Marco-Ferreres, Raquel ; Brosens, Jan J ; Beccari, Leonardo L ; Bovolenta, Paola ; Benayoun, Bérénice A ; Monteiro, Lara J ; Schwenen, Helma DC ; Grontved, Lars ; Wederell, Elizabeth ; Mandrup, Susanne ; Veitia, Reiner A ; Chakravarthy, Harini ; Hoodless, Pamela A ; Mancarelli, M Michela ; Torbett, Bruce E ; Banham, Alison H ; Reddy, Sekhar P ; Cullum, Rebecca L ; Liedtke, Michaela ; Tschan, Mario P ; Vaz, Michelle ; Rizzino, Angie ; Zannini, Mariastella ; Frietze, Seth ; Farnham, Peggy J ; Eijkelenboom, Astrid ; Brown, Philip J ; Laperrière, David ; Leprince, Dominique ; de Cristofaro, Tiziana ; Prince, Kelly L ; Putker, Marrit ; del Peso, Luis ; Camenisch, Gieri ; Wenger, Roland H ; Mikula, Michal ; Rozendaal, Marieke ; Mader, Sylvie ; Ostrowski, Jerzy ; Rhodes, Simon J ; Olechnowicz, Sam WZ ; Breslin, Mary B ; Lan, Michael S ; Nanan, Kyster K ; Wegner, Michael ; Hou, Juan ; Mullen, Rachel D ; Colvin, Stephanie C ; Noy, Peter John ; Webb, Carol F ; Witek, Matthew E ; Ferrell, Scott ; Daniel, Juliet M ; Waldman, Scott A ; Peet, Daniel J ; Taggart, Michael ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karrich, Julien J ; Blom, Bianca ; Vesuna, Farhad ; O'Geen, Henriette ; Sun, Yunfu ; Gronostajski, Richard M ; Woodcroft, Mark W ; Hough, Margaret R ; Chen, Edwin ; Europe-Finner, G Nicholas ; Karolczak-Bayatti, Magdalena ; Bailey, Jarrod ; Hankinson, Oliver ; Raman, Venu ; LeBrun, David P ; Biswal, Shyam ; DeBruyne, Jason P ; Hogenesch, John B ; Hevner, Robert F ; Héligon, Christophe ; Luo, Xin M ; Blank, Marissa Cathleen ; Millen, Kathleen Joyce ; Sharlin, David S ; Forrest, Douglas ; Dahlman-Wright, Karin ; ... 2012

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The Transcription Factor Encyclopedia
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The Transcription Factor Encyclopedia

Yusuf, Dimas ; Butland, Stefanie L ; Swanson, Magdalena I ; Bolotin, Eugene ; Ticoll, Amy ; Cheung, Warren A ; Zhang, Xiao Yu Cindy ; Dickman, Christopher T. D ; Fulton, Debra L ; Lim, Jonathan S ; Schnabl, Jake M ; Ramos, Oscar H. P ; Vasseur-Cognet, Mireille ; de Leeuw, Charles N ; Simpson, Elizabeth M ; Ryffel, Gerhart U ; Lam, Eric W.-F ; Kist, Ralf ; Wilson, Miranda S. C ; Marco-Ferreres, Raquel ; Brosens, Jan J ; Beccari, Leonardo L ; Bovolenta, Paola ; Benayoun, Bérénice A ; Monteiro, Lara J ; Schwenen, Helma D. C ; Grontved, Lars ; Wederell, Elizabeth ; Manup, Susanne ; Veitia, Reiner A ; Chakravarthy, Harini ; Hoodless, Pamela A ; Mancarelli, M. Michela ; Torbett, Bruce E ; Banham, Alison H ; Reddy, Sekhar P ; Cullum, Rebecca L ; Liedtke, Michaela ; Tschan, Mario P ; Vaz, Michelle ; Rizzino, Angie ; Zannini, Mariastella ; Frietze, Seth ; Farnham, Peggy J ; Eijkelenboom, Astrid ; Brown, Philip J ; Laperrière, David ; Leprince, Dominique ; de Cristofaro, Tiziana ; Prince, Kelly L ; Putker, Marrit ; del Peso, Luis ; Camenisch, Gieri ; Wenger, Roland H ; Mikula, Michal ; Rozendaal, Marieke ; Mader, Sylvie ; Ostrowski, Jerzy ; Rhodes, Simon J ; van Rechem, Capucine ; Boulay, Gaylor ; Olechnowicz, Sam W. Z ; Breslin, Mary B ; Lan, Michael S ; Nanan, Kyster K ; Wegner, Michael ; Hou, Juan ; Mullen, Rachel D ; Colvin, Stephanie C ; Noy, Peter John ; Webb, Carol F ; Witek, Matthew E ; Ferrell, Scott ; Daniel, Juliet M ; Park, Jason ; Waldman, Scott A ; Peet, Daniel J ; Taggart, Michael ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karrich, Julien J ; Blom, Bianca ; Vesuna, Farhad ; O'Geen, Henriette ; Sun, Yunfu ; Gronostajski, Richard M ; Woodcroft, Mark W ; Hough, Margaret R ; Chen, Edwin ; Europe-Finner, G. Nicholas ; Karolczak-Bayatti, Magdalena ; Bailey, Jarrod ; Hankinson, Oliver ; Raman, Venu ; Lebrun, David P ; Biswal, Shyam ; Harvey, Christopher J ; Debruyne, Jason P ; Hogenesch, John B ; Hevner, Robert F ; Héligon, Christophe ; ...

GenomeBiology.com, 2012, Vol.13 (3)

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The transcription factor encyclopedia
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Yusuf, Dimas ; Butland, Stefanie L ; Swanson, Magdalena I ; Bolotin, Eugene ; Ticoll, Amy ; Cheung, Warren A ; Zhang, Xiao Yu Cindy ; Dickman, Christopher T D ; Fulton, Debra L ; Lim, Jonathan S ; Schnabl, Jake M ; Ramos, Oscar H P ; Vasseur-Cognet, Mireille ; de Leeuw, Charles N ; Simpson, Elizabeth M ; Ryffel, Gerhart U ; Lam, Eric W-F ; Kist, Ralf ; Wilson, Miranda S C ; Marco-Ferreres, Raquel ; Brosens, Jan J ; Beccari, Leonardo L ; Bovolenta, Paola ; Benayoun, Bérénice A ; Monteiro, Lara J ; Schwenen, Helma D C ; Grontved, Lars ; Wederell, Elizabeth ; Mandrup, Susanne ; Veitia, Reiner A ; Chakravarthy, Harini ; Hoodless, Pamela A ; Mancarelli, M Michela ; Torbett, Bruce E ; Banham, Alison H ; Reddy, Sekhar P ; Cullum, Rebecca L ; Liedtke, Michaela ; Tschan, Mario P ; Vaz, Michelle ; Rizzino, Angie ; Zannini, Mariastella ; Frietze, Seth ; Farnham, Peggy J ; Eijkelenboom, Astrid ; Brown, Philip J ; Laperrière, David ; Leprince, Dominique ; de Cristofaro, Tiziana ; Prince, Kelly L ; Putker, Marrit ; del Peso, Luis ; Camenisch, Gieri ; Wenger, Roland H ; Mikula, Michal ; Rozendaal, Marieke ; Mader, Sylvie ; Ostrowski, Jerzy ; Rhodes, Simon J ; Van Rechem, Capucine ; Boulay, Gaylor ; Olechnowicz, Sam W Z ; Breslin, Mary B ; Lan, Michael S ; Nanan, Kyster K ; Wegner, Michael ; Hou, Juan ; Mullen, Rachel D ; Colvin, Stephanie C ; Noy, Peter John ; Webb, Carol F ; Witek, Matthew E ; Ferrell, Scott ; Daniel, Juliet M ; Park, Jason ; Waldman, Scott A ; Peet, Daniel J ; Taggart, Michael ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karrich, Julien J ; Blom, Bianca ; Vesuna, Farhad ; O'Geen, Henriette ; Sun, Yunfu ; Gronostajski, Richard M ; Woodcroft, Mark W ; Hough, Margaret R ; Chen, Edwin ; Europe-Finner, G Nicholas ; Karolczak-Bayatti, Magdalena ; Bailey, Jarrod ; Hankinson, Oliver ; Raman, Venu ; LeBrun, David P ; Biswal, Shyam ; Harvey, Christopher J ; DeBruyne, Jason P ; Hogenesch, John B ; Hevner, Robert F ; Héligon, Christophe ; ...

Genome biology, 2012, Vol.13 (3), p.R24-R24 [Peer Reviewed Journal]

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The Transcription Factor Encyclopedia
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Yusuf, Dimas ; Butland, Stefanie L ; Swanson, Magdalena I ; Bolotin, Eugene ; Ticoll, Amy ; Cheung, Warren A ; Cindy Zhang, Xiao ; Dickman, Christopher TD ; Fulton, Debra L ; Lim, Jonathan S ; Schnabl, Jake M ; Ramos, Oscar HP ; Vasseur-Cognet, Mireille ; de Leeuw, Charles N ; Simpson, Elizabeth M ; Ryffel, Gerhart U ; Lam, Eric W-F ; Kist, Ralf ; Wilson, Miranda SC ; Marco-Ferreres, Raquel ; Brosens, Jan J ; Beccari, Leonardo L ; Bovolenta, Paola ; Benayoun, Bérénice A ; Monteiro, Lara J ; Schwenen, Helma DC ; Grontved, Lars ; Wederell, Elizabeth ; Mandrup, Susanne ; Veitia, Reiner A ; Chakravarthy, Harini ; Hoodless, Pamela A ; Mancarelli, M Michela ; Torbett, Bruce E ; Banham, Alison H ; Reddy, Sekhar P ; Cullum, Rebecca L ; Liedtke, Michaela ; Tschan, Mario P ; Vaz, Michelle ; Rizzino, Angie ; Zannini, Mariastella ; Frietze, Seth ; Farnham, Peggy J ; Eijkelenboom, Astrid ; Brown, Philip J ; Laperrière, David ; Leprince, Dominique ; de Cristofaro, Tiziana ; Prince, Kelly L ; Putker, Marrit ; del Peso, Luis ; Camenisch, Gieri ; Wenger, Roland H ; Mikula, Michal ; Rozendaal, Marieke ; Mader, Sylvie ; Ostrowski, Jerzy ; Rhodes, Simon J ; Van Rechem, Capucine ; Boulay, Gaylor ; Olechnowicz, Sam WZ ; Breslin, Mary B ; Lan, Michael S ; Nanan, Kyster K ; Wegner, Michael ; Hou, Juan ; Mullen, Rachel D ; Colvin, Stephanie C ; Noy, Peter ; Webb, Carol F ; Witek, Matthew E ; Ferrell, Scott ; Daniel, Juliet M ; Park, Jason ; Waldman, Scott A ; Peet, Daniel J ; Taggart, Michael ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karrich, Julien J ; Blom, Bianca ; Vesuna, Farhad ; O'Geen, Henriette ; Sun, Yunfu ; Gronostajski, Richard M ; Woodcroft, Mark W ; Hough, Margaret R ; Chen, Edwin ; Europe-Finner, G Nicholas ; Karolczak-Bayatti, Magdalena ; Bailey, Jarrod ; Hankinson, Oliver ; Raman, Venu ; LeBrun, David P ; Biswal, Shyam ; Harvey, Christopher J ; DeBruyne, Jason P ; Hogenesch, John B ; Hevner, Robert F ; Héligon, Christophe 2012

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The Transcription Factor Encyclopedia
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The Transcription Factor Encyclopedia

Yusuf, Dimas ; Butland, Stefanie L ; Swanson, Magdalena I ; Bolotin, Eugene ; Ticoll, Amy ; Cheung, Warren A ; Cindy Zhang, Xiao Y ; Dickman, Christopher T. D ; Fulton, Debra L ; Lim, Jonathan S ; Schnabl, Jake M ; Luo, Xin M ; Blank, Marissa C ; Millen, Kathleen J ; Sharlin, David S ; Forrest, Douglas ; Dahlman-Wright, Karin ; Zhao, Chunyan ; Mishima, Yuriko ; Sinha, Satrajit ; Chakrabarti, Rumela ; Ramos, Oscar H. P ; Portales-Casamar, Elodie ; Sladek, Frances M ; Bradley, Philip H ; Wasserman, Wyeth W ; Vasseur-Cognet, Mireille ; de Leeuw, Charles N ; Simpson, Elizabeth M ; Ryffel, Gerhart U ; Lam, Eric W.-F ; Kist, Ralf ; Wilson, Miranda S. C ; Marco-Ferreres, Raquel ; Brosens, Jan J ; Beccari, Leonardo L ; Bovolenta, Paola ; Benayoun, Bérénice A ; Monteiro, Lara J ; Schwenen, Helma D. C ; Grontved, Lars ; Wederell, Elizabeth ; Mandrup, Susanne ; Veitia, Reiner A ; Chakravarthy, Harini ; Hoodless, Pamela A ; Mancarelli, M. Michela ; Torbett, Bruce E ; Banham, Alison H ; Reddy, Sekhar P ; Cullum, Rebecca L ; Liedtke, Michaela ; Tschan, Mario P ; Vaz, Michelle ; Rizzino, Angie ; Zannini, Mariastella ; Frietze, Seth ; Farnham, Peggy J ; Eijkelenboom, Astrid ; Brown, Philip J ; Laperrière, David ; Leprince, Dominique ; de Cristofaro, Tiziana ; Prince, Kelly L ; Putker, Marrit ; del Peso, Luis ; Camenisch, Gieri ; Wenger, Roland H ; Mikula, Michal ; Rozendaal, Marieke ; Mader, Sylvie ; Ostrowski, Jerzy ; Rhodes, Simon J ; van Rechem, Capucine ; Boulay, Gaylor ; Olechnowicz, Sam W. Z ; Breslin, Mary B ; Lan, Michael S ; Nanan, Kyster K ; Wegner, Michael ; Hou, Juan ; Mullen, Rachel D ; Colvin, Stephanie C ; Noy, Peter J ; Webb, Carol F ; Witek, Matthew E ; Ferrell, Scott ; Daniel, Juliet M ; Park, Jason ; Waldman, Scott A ; Peet, Daniel J ; Taggart, Michael ; Jayaraman, Padma-Sheela ; Karrich, Julien J ; Blom, Bianca ; Vesuna, Farhad ; O'Geen, Henriette ; Sun, Yunfu ; Gronostajski, Richard M ; Woodcroft, Mark W ; ... 2012

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